CAG的发生是多种因素综合作用的结果，与Hp感染、免疫、十二指肠液反流、遗传、年龄、高盐及低维生素饮食等相关。
一、感染因素：
1、H.pylori感染
Hp感染是慢性胃炎的主要病因（80％~95％），亦是形成CAG的重要原因之一，长期感染（约5~25年）后，部分患者可有胃黏膜萎缩和肠化。Hp引发CAG的机制：Hp通过鞭毛在胃内穿过黏液层移向胃黏膜，同时分泌黏附素使其紧贴上皮细胞，菌体释放的尿素酶分解尿素产生NH3，从而保持细菌周围中性的环境，有利于细菌在胃黏膜表面的定植：
（1）Hp通过产氨作用、分泌空泡毒素A（vacA）等物质而引起细胞损害；
（2）细胞毒素相关基因A（cagA）蛋白可引起胃黏膜强烈的炎症反映；
（3）菌体胞壁可作为抗原诱导免疫反映。这些因素的长期存在导致胃黏膜的慢性炎症，后者可导致胃固有腺体破坏而发生萎缩。
2 、其他感染
其他病原微生物在胃黏膜的感染与CAG的发生也有一定的相关性。有研究报道EB病毒在CAG患者中的检出率增高，且EBv感染可能在CAG向胃癌的发展过程中起重要作用。某些地区，CAG患者的胃液中，真菌检出率很高。
二、免疫机制：
1 、自身免疫性胃炎
胃体萎缩为主的慢性胃炎发生在自身免疫基础上，或称A型胃炎。患者血液中存在自身抗体即内因子抗体（intrinsic factor antibody, IFA）和壁细胞抗体（parietal cell antibody, PCA）。内因子抗体（IFA）分为两型：Ⅰ型又称阻断抗体，能防止维生素B12与内因子结合，以致维生素B12不能被吸收；Ⅱ型又称结合抗体，能与内因子维生素B12复合物结合，阻碍维生素B12的吸收，导致恶性贫血。壁细胞抗体（PCA）在一般萎缩性胃炎中阳性率为20％~60％，可使壁细胞总数减少，导致胃酸分泌减少或缺乏。
2 、其他免疫因素
Nandelli用B型萎缩性胃炎的胃黏膜作用于各种自身免疫抗体发现了胃泌素分泌细胞抗体（gastrin secretory cell antibody, GCA）。GCA与B型萎缩性胃炎有关。实验证明GCA为G细胞浆的特殊自身免疫抗体，属IgG系，具有补体结合能力，说明B型中有一部分患者，其病变与G细胞自身免疫有关。然而胃窦炎仅10％有GCA，故需研究其他致病因素。
细胞免疫：如淋巴细胞转化、巨噬细胞移动抑制、各种皮肤试验及肿瘤细胞杀伤试验等均证实慢性胃炎有细胞免疫存在。CAG胃上皮细胞内普遍可见淋巴细胞，有些病例观察到淋巴细胞有丝分裂或伪足，导致邻近壁细胞质膜溶解现象，说明在发病过程中细胞免疫现象与胃黏膜病变同时发生。
三、十二指肠液反流
十二指肠液的反流，胆汁、胰液和肠液大量反流入胃，削弱胃黏膜屏障功能，使胃黏膜遭到消化液的作用，产生炎症、糜烂、出血和黏膜上皮萎缩、化生性变化等。
胆汁反流被认为是CAG的致病因素之一。胆汁反流可损害胃黏膜屏障，胃腔内的H+通过受损的屏障反弥散入胃黏膜内，刺激组胺分泌增加，组胺作用于血管H1受体、H2受体引起血管扩张，渗透性增强，胃黏膜有效血流量减少，黏膜修复功能减弱；同时组胺又可使胃酸分泌增多，加重胃黏膜损伤，从而导致CAG的发生。此外反流可刺激胃泌素释放抑制幽门括约肌，使胆汁反流形成恶性循环。有报道显示，胆汁反流性胃炎患者胃黏膜的萎缩、肠化生及异型增生的比例明显高于非胆汁反流组，差异具有显著性（P<0.05）。
四、其他因素
1 年龄
CAG的发病率随年龄而增高，萎缩、肠化、异型增生也随年龄而增多和加重。这可能是老年人小动脉硬化、胃黏膜退行性改变，使黏膜营养不良，分泌功能下降、胃黏膜屏障功能减低所致，成为老年人发生CAG的重要因素。
2 、营养因素
维生素缺乏：CAG的高发年龄在50岁以上，大量临床资料已明确提示老年人群维生素B12、叶酸缺乏。长期Hp感染会抑制胃黏膜分泌维生素C，使维生素C对氧自由基和亚硝酸盐的清除能力下降，从而加重CAG的病变程度。
胃黏膜营养因子缺乏：如胃泌素、表皮生长因子、抑胃素等，或胃黏膜感觉神经终器对这些因子不敏感也可引起胃黏膜萎缩。慢性缺铁和缺血缺氧可导致胃黏膜受损。某些微量元素如锌和硒缺乏可影响氧自由基清除酶活性，为胃黏膜损害可能有关。
3、理化因素
生活方式：目前国内外学者普遍认为CAG的发生与生活方式、饮食习惯有很大关系，长期反复进食强烈的刺激性食品如烈酒、浓茶、咖啡、泡菜，过热或过冷饮食，水果、蔬菜摄入过少均与CAG发生相关。
药物：非甾体类抗炎药（NSAIDs）如阿司匹林和保泰松可引起胃黏膜糜烂，糜烂愈合后可遗留慢性胃炎。有一些抗生素对胃黏膜亦有一定损害，但目前尚无证据说明长期服用可引起CAG。
金属接触与放射：重金属如汞、铜及锌等对胃黏膜都有一定的损伤作用，如铅作业者胃黏膜活检发现CAG的发病率也增高，Palmer称之为排泄性胃炎（excretion gastritis）。放射治疗溃疡病或其他肿瘤，可使胃黏膜损伤甚至萎缩。
4、遗传
据Varis调查显示，CAG患者的第一代亲属间，其发病率明显增高，且恶性贫血的遗传倾向也很明显，与对照组相比大20倍，人体的遗传性易感倾向是这部分CAG发病的重要体质条件。
