侵入人体并引起扁桃体炎的病原微生物相当多。百分之七十是病毒感染，如鼻病毒、冠状病毒、腺病毒、流感病毒、副流感病毒、肠病毒等。剩下的少数是细菌感染
。其余少数是由细菌感染引起的
。病毒感染后往往会出现细菌感染，产生更严重的临床表现。
扁桃体炎的症状随每个生物体的抵抗力和病菌的不同而不同，有多种表现。有些人可能有轻微的感冒症状，颈部淋巴结肿大，以及口腔溃疡。当然，也可能有更多的
严重的感冒症状，全身不适等。有时，扁桃体肿胀得很厉害，以至于使鼻子不能很好地呼吸。有些病毒
甚至可能使扁桃体肿胀到出现上呼吸道阻塞的症状，使病人难以呼吸。
