药物流产的优点
不需要对子宫进行操作，减少了粘连和感染的机会。缺点是服药时间长，腹痛时间长，有10%的机会流产失败，需要切除子宫，而且术后出血时间长。
人工流产的优点
快速，出血量少，静脉麻醉下无腹痛或术后腹痛轻微。术后出血量少。缺点是需要对子宫进行操作，与药物流产相比，感染或粘连的机会较高。在某些情况下，如医生技术不熟练，有子宫肌瘤，子宫极度前倾后屈时发生残留，事后需进行第二次手术。
药物治疗和人工流产的副作用
药物治疗或人工流产都可能出现一些副作用。医生会在流产或药物流产前解释并签署一份知情同意书。
人工流产可能出现的副作用：麻醉意外心脑综合征 羊水栓塞 术中出血 多次感染 漏吸 吸空 残留粘连 继发性不孕 其他不可预知的情况。
药物流产可能发生的情况：药物流产过程中或流产后出血、感染、残留剥离或整个胚胎不能排除（失败），需要清宫，刺激不孕等不可预测的情况。
如何选择药流或人流
首先要认真进行门诊检查，包括血尿常规、白带常规、妇科检查、感染筛查、血型、凝血时间等检查，进行全面评估。在进行药物或人工流产之前，还要做超声波检查以确定是否为宫内妊娠。
药物流产限于怀孕49天。太大或太小都容易失败。堕胎的年龄不应超过40岁。第一次做了药物流产的人，不应选择再次做药物流产。肝功能异常者不适合做人工流产。
人工流产适合于妊娠10周以内、没有比较严重的疾病、子宫位置或形状没有比较明显的异常的人。一些特殊情况，如子宫颈不易暴露、有子宫肌瘤、子宫瘢痕、宫颈妊娠、子宫瘢痕等，做人工流产的风险很大，需要医生仔细评估。
在妊娠49天内的首次怀孕，没有药物流产的禁忌症，可以先考虑药物流产。
