禽流感的症状因品种、年龄、性别、合并感染的程度、病毒的毒力和环境因素而异，主要表现为呼吸、消化、生殖或神经系统的异常。
常见的症状包括：病鸡精神萎靡，饲料消耗减少，昏昏欲睡；母鸡筑巢增多，产蛋量下降；轻到重的呼吸道症状，包括咳嗽、打喷嚏和大量流泪；头部和面部水肿，神经紊乱和腹泻。
这些症状中的任何一个都可能单独出现，或以不同的组合出现。有时疾病的爆发很迅速，在没有明显症状的情况下，鸡就被发现死亡。
此外，禽流感的发病率和死亡率差别很大，取决于鸟的种类和品系以及年龄、环境和合并感染，通常是发病率高，死亡率低。在高致病性的病毒感染中，发病率和死亡率可以达到100%。
禽流感的潜伏期从几小时到几天不等，其长度与病毒的致病性、感染病毒的剂量、感染途径和被感染鸟类的种类有关。
