英国胸科学会的指南中推荐常规疗法治疗支气管扩张：患者教育，气道分泌物清除(包括运动、理疗和药物治疗)，气道药物治疗(支气管舒张剂和抗炎治疗)，抗感染治疗，必要时行手术切除。应依据疾病的严重程度、感染的病原菌种类、症状的发生频率、以及是否有能够治疗的合并症来实施个体化治疗。通常采用阶梯式的治疗方法。
无论是慢性期还是急性加重期的治疗，抗生素都必不可少。抗感染治疗需要针对特定病原体，做到有的放矢，因此行痰标本培养来明确感染的病原体和其对相应抗生素的易感性相当重要。近期一项研究证实，支扩患者气道细菌负荷量大于气道和全身性炎症有关，短期和长期的抗生素治疗均能降低炎症指标。
抗感染治疗指征
多种因素决定了支扩患者初始抗生素治疗的时机。其中最重要的为患者咳嗽的严重程度和频率、痰量和痰的性状、是否出现咯血和急性加重的严重程度和频率。若患者检测到铜绿假单胞菌或非结核分支杆菌感染时，医生应该开始抗感染治疗。
抗生素既可作为慢性期治疗的一部分，也可仅用于急性期治疗。也有少量文献报道，在首次检测出铜绿假单胞菌或MRSA时，即开始抗生素治疗以清除上述两种细菌的感染。
抗生素的选择和适用于哪些支扩患者，均应依照现有的证据和临床指南/共识/临床综述来作出决定。抗生素治疗应该个体化、治疗方案应多元化，应对患者自身状况来选择必须的治疗方案(包括清除气道分泌物，舒张支气管，抗炎治疗)，从而改善患者症状和生活质量，减少急性加重次数和尽可能延缓肺功能下降。
1. 现有文献支持对频繁出现急性加重的支扩患者采用长期大环内酯类药物治疗。
2. II期临床研究表明，吸入氟喹诺酮类抗生素对支扩患者疗效较好，3期临床研究尚在进行当中。
3. 部分吸入性抗生素对支扩治疗无效，最近发现的为氨曲南。
4. 尚需更多的证据来明确粘菌素吸入对存在铜绿假单胞菌慢性感染的支扩患者的疗效。
