(1)病原微生物：包括细菌、病毒、螺旋体、立克次体等，是引起咽炎的病因，可直接来源于空气、饮食，也可间接来源于血液循环和淋巴循环。
(2)物理或化学性刺激：如讲话过多，喜食辛辣、烫热饮食，烟酒过度，化学性气体、粉尘等空气污染，均可损伤咽部粘膜上皮和腺体。破坏局部防御体系这也是引起咽炎的病因。
(3)气候、季节因素：寒冷可造成咽部粘膜血管收缩，吞噬细胞数目减少，局部抵抗力下降;干燥可影响咽部粘液分泌和纤毛蠕动，降低对空气的清洁、加湿作用，直接对咽部粘膜造成刺激和损害;冬春季节气候变化大，室内空气流通差，也容易引起抵抗力下降和致病微生物入侵。
(4)邻近器官疾病：鼻腔;鼻窦、口腔、牙齿、牙龈、喉、气管、支气管等邻近器官的急、慢性炎症，沿着粘膜、粘膜下组织、局部淋巴和血液循环侵犯到咽部，或炎性分泌物反复刺激咽部，或鼻病呼吸受阻而被迫张口呼吸等，均可导致咽炎。
(5)全身疾病：过敏体质或患有全身疾病，如风湿热、痛风、糖尿病，心脏病、贫血、肾炎、气管炎、肺气肿、支气管扩张、结核、肝硬变及消化系统疾病造成的营养不良、便秘等，均可导致全身抵抗力下降、咽部血液循环障碍，进而引发咽炎。
(6)其它过度疲劳，精神紧张，睡眠不足等也是引起咽炎的病因。
