一般来说，先天性消化道畸形所致的病理性呕吐情况较严重，次数频繁，呕吐量大，常呈喷射状，呕吐物中除进食的奶汁外，还会含有胆汁，或呕吐物为粪样液。如果婴儿出生后唾液较多，初次进食，吞1、2口奶后即有呕吐、呛咳、青紫甚至窒息，多为食管闭锁所致;出生后不排胎便或量少，1-2天后会出现肠梗阻症状：频繁呕吐，呕吐物中含有胆汁或呕吐物为粪样液，腹胀明显，腹壁发亮，有扩张静脉，经直肠指检或灌肠后排出大量大便，多为先天性巨结肠;出生后无症状，吃奶及大小便均正常，2-3周后出现呕吐，逐渐加重，直至每次喂奶后立即呕吐或不久即呕吐、常呈喷射状，则多为先天性幽门肥厚狭窄。先天性畸形一般需手术治疗，药物治疗无效。
小儿内科性疾病所致的呕吐常常发病症状明显，呕吐一般不甚严重或间歇性发作，如新生儿窒息所致的脑水肿和颅内出血除呕吐症状外，常有呻吟、发绀、抽搐等症状;新生儿上呼吸道感染常有发热、流涕、鼻塞、咳嗽等症状;败血症和脑膜炎常有反应差、精神萎靡、拒食、不动、黄疸等症状;肺炎常有发热、呼吸急促、口吐泡沫、发绀等症状。
