其实，正常人的心脏受交感神经和副交感神经的双重精细调节。交感神经兴奋使心跳加速、均齐，以适应人体活动或环境变化的需要;迷走神经兴奋，心跳减慢、易出现窦性心律不齐，使机体养精蓄锐。在交感神经和副交感神经的双重精细调节下，呼吸、体位的变化，有时候就会出现窦性心律不齐。
窦性心律不齐可分为：呼吸性窦性心律不齐、非呼吸性窦性心律不齐、窦房结内游走性节律、和心房内游走节律。其中，呼吸性窦性心律不齐占大多数，多见于正常青少年，与迷走神经的兴奋性有关，多见于心动过缓时，屏住呼吸则窦性心律不齐消失;窦房结内游走性节律，亦多见于正常健康人，为正常的生理反应或正常的心律变异，不能和心律失常或心脏病划等号。
以上情况，占窦性心律不齐的大多数，少数就诊者可有心悸表现，需耐心正确解释。
少数非呼吸性窦性心律不齐，可见于正常老年人、冠心病、颅内压增高、洋地黄、吗啡等的作用，或结构性心脏病等。病理条件下的窦性心律不齐，不齐程度一般较重。对这些类患者，原发病的诊断一般比较明确，严重窦性心律不齐也只不过是疾病的外在表现之一，治疗也只且只能是针对原发病，而不是针对窦性心律不齐本身。
