HPV通常情况下是通过生殖器接触的性传播
在一次性生活中发生HPV传播的机会并不清楚，但是文献报道大约是65％或是更高。
同样，多数研究发现宫颈HPV病变的妇女，其性伴侣中有64-70％在接受检查时可以发现生殖器的HPV病变。而这种病变非常微小，当事人可能根本无法察觉。
通常情况下，在一次性生活中传染了HPV，大约经过4周到8个月的时间可能发展成生殖器疣，但是也有些感染会潜伏下来，在几年甚至数十年后发展成为疣或宫颈病变。所以要准确判定感染HPV的时间是不可能的。
当一方发生了HPV病变，那么性生活的双方可能会同时感染上一种类型的HPV。性生活中使用避孕套可以减少病毒的暴露，可以加速HPV的清除。当HPV病毒负荷下降了，自身的免疫系统就能更有效的清除病毒。
口交也是HPV传播的途径。不过有研究发现在头颈部的鳞状上皮中有四分之一存在者高危HPV，所以口交引起的HPV传播尽管存在，但罕致严重的疾病。
除了性生活之外，一些间接的接触，比方说使用坐便器，门把手，香皂，游泳池，浴盆，也都会导致HPV的传播。所以说它的传播是多途径的，甚至深入到日常生活中。
HPV6和11会在阴道分娩是传染给新生儿，导致上呼吸道或候部的疣，但是也很少发生，剖腹产可减少此风险。而如果生殖器疣治愈了6个月以上，那么阴道分娩传染HPV的可能性就更低了。
