SCC最初是从宫颈癌组织中分离出来的，是一种丝氨酸蛋白酶抑制剂和一种高度特异的肿瘤标志物，主要用于诊断鳞状癌。
SCC分布在全身正常组织的鳞状上皮细胞内，因此正常的外周血含有一定范围的SCC水平。然而，随着鳞状上皮细胞的恶性增殖，细胞内的SCC会迅速释放到血液中，从而引发外周血SCC的增加。因此，SCC对所有鳞状上皮细胞来源的癌症的诊断和监测有意义。例如：宫颈鳞癌、肺鳞癌、食道鳞癌、口腔、鼻咽、膀胱、肛管和皮肤的鳞癌。
对于上述已发现的肿瘤，SCC浓度的变化与其治疗效果、复发、转移和病情进展以及评估其预后有密切关系：
临床上SCC水平的异常升高应引起重视，警惕上述肿瘤的发生。一旦发生SCC水平的异常升高，首先要重复抽血，然后进一步复查，排除 如果SCC水平仍然很高，需要进一步进行全面的体格检查，以及影像学检查，如胸腔、腹部和盆腔的增强CT。SCC的异常升高往往预示着病变的存在，而PET-CT可以最早发现病变。早期发现和早期治疗将带来更好的结果。
在临床上，SCC可能比症状和体征早几个月，因此，即使在影像学上没有发现异常，密切随访监测SCC的变化也很重要。SCC只是表明体内存在鳞癌的风险，需要进一步确认，需要影像学和病理学诊断。
SCC在临床上对监测肿瘤复发也很重要。
