1、抗抑郁药
一般选用氯丙咪嗪、丙咪嗉和 5-羟色胺再摄取抑制荆( SSRS)，如氟西汀，色曲林、氟伏沙明(兰释)等，也有应用丁螺环酮治疗儿童自闭症，可以减少刻板行为、自伤行为、攻击行为和改善社合交往异常的症状。
2、抗精神病药
诊断明确后，根据患儿具体情况，选用药物、按医嘱用药及规律按时服药，维持治疗，通常可以减轻多动、冲动、哭闹及攻击行为，改善行为，稳定情绪等作用。
(1)典型的抗精神病药，包括氯丙嗪、舒必利，氟哌啶醇等。
(2)非典型的抗精神病药，包括利培酮(维思通)、氯氮平、奥氮平等。临床近来常用小刑量利培酮治疗自闭症，可减轻多动、冲动、攻击行为、强迫重复行为症状，某些患儿可增进社合交往，奥氮平也有类似效果。
3、情绪稳定剂
包括丙戊酸纳、卡马西平、碳酸锂,心得安、氯硝西泮，用药治疗的目的是控制、稳定自闭症儿童的情绪激功、哭同不安、紫张恐俱和自伤行为 等症状。
4、维生素和镁盐
曾有应用大刑量维生素 B6和镁盐治疗儿童自闭症，这两种药物主要影晌神经递质的代榭。结果意见不一，有认为可改善睡眠，减少多动和易激惹性，减少攻击、自伤行为，增强注意力。也有认为对自闭症无明显作用，而且剂量过大可能产生不良副反应，包括恶心、呕吐、腹污、激动、失眠、停药征候群等。
5、中枢兴奋剂
中枢兴奋剂，如哌甲酯(利他林)和匹莫林，主要应用于患儿表现有严重的过份多动及注意不集中者，谨慎选用，有癫痫(是一种以大脑神经元异常放电引发突然、短暂且反复发作的脑部功能失常为特征的综合征。)发作及脑电图有痫样放点者不宜服用。这类药物的目的为改善活功过度、注意涣散等症状。
6、多巴胺( DA)拮抗剂
2001年有学者报告应用Amantadine Hcl治疗儿童自闭症，该药是治疗帕金森氏病和药物引起锥休外系统障碍的药品，应用于治疗自闭症剂量0.25mg- 5 mg每公斤/每日，结果发现对多动、激动、行为障碍是一种安全有效的药物、但尚待临床进一步研究观察。
7、拮抗吗啡药
有应用钠屈酮( Nalterxone)，是一种吗啡阻滞剂，治疗自闭症每日剂量每公斤体重 O.5 mg—2mg，可减轻过分活功，冲动、刻板行力、自伤行为、增加眼对视及社交行为。
