常規的羊水穿刺術後要經過一系列複雜的步驟，如培養、收穫、染色、讀取羊水進行胎兒染色體核型分析，這需要幾周的等待時間。這幾周對孕婦和她的家人來說都是一種折磨，尤其是隨著孕周逐漸變大，胎動也越來越明顯，更增加了孕婦的恐懼感，因為幾周後被告知胎兒有問題，需要引產，因此臨床需要快速診斷。
對於一些焦慮的、高風險的、年齡較大的婦女，可以考慮進行快速診斷，以儘早知道胎兒是否正常。一些醫院可以使用熒光原位雜交技術（FISH）來分析羊水中的胎兒細胞，利用13、18、21、X和Y的染色體特異性DNA探針來檢測胎兒最常見的染色體異常。通常2-3天就可以得到結果，基本上涵蓋了95%的常見染色體異常。如果有兩個染色體位點，說明染色體數目正常，如果在21號染色體上有三個染色體位點，說明胎兒可能是唐氏綜合症系，結合常規的核型分析，可以早期得出結論。
