包莖是因為小兒包皮口狹小，緊緊地包住陰莖頭，以致不能將包皮向後翻，使陰莖頭顯露在外。生理性或先天性的包莖有時非常嚴重，只看到包皮口，看不到尿道口，包皮根本不能向後翻，以致陰莖頭一直龜縮在內，另外有一種稱為後天性包莖，是因為包皮或陰莖頭的炎症、損傷引起包皮口疤痕形成，將陰莖頭包住，這兩種包莖非進行手術不可。
小兒包莖是十分常見的，隨著孩子的漸漸長大，包皮口會漸漸擴張，包皮粘連會逐漸分離，陰莖頭會慢慢顯露出來。一般情況下，男孩到了3至5歲，有75%左右陰莖頭能顯露出來，但此時有很多兒童即便露出龜頭還會存在包皮部分粘連的情況。生理性包莖，可將包皮反覆試行上翻，以此擴大包皮口。手法要輕柔，循序漸進，不要過分急於將包皮完全上翻。當陰莖頭露出後，清潔包皮垢，塗上抗菌素藥膏使其潤滑，然後將包皮翻下來複原，避免造成包皮嵌頓。家長可以經常幫助他們輕輕地翻轉包皮，清除包皮垢。每天用溫水清洗包皮口，達到預防感染的目的。
兒童期的小兒包莖是正常的，小兒包莖嬰兒有包莖或兒童有包皮過長，如無併發症，不應施行包皮環切術。由於3歲以下小兒的包莖多隨年齡的增長而自行消失;另一部分兒童只要反覆將包皮向上退縮，小兒包莖擴大包皮囊口，就會露出陰莖頭，也不必手術切除。除非必要、或至少無害時才應實施這一手術。
