早孕試紙是不完全可靠的，因為它是一個定性檢查，也就是隻顯示陽性和陰性——陽性是懷孕，陰性就沒懷孕，是很粗略的分辨。只有當血裡面的HCG值達到一定濃度時，尿裡才會顯示出陽性，早孕試紙也不是100%準確的，比如在病理情況下，如宮外孕、葡萄胎或絨毛膜癌等，也會出現陽性反應。並且早孕試紙雖號稱具有99%的準確率，但在沒有醫生指導的情況下，一般測試結果只能達到50%-75%的精確率。
早孕試紙不但不能確定是否為宮外孕，甚至有時都不能準確判斷是否懷孕。正常情況下，婦女懷孕後胚胎種植在子宮腔內稱為宮內孕，若種植在子宮腔外某處則稱宮外孕，醫學上又稱為異位妊娠。宮外孕部位最多見於輸卵管，少數也可見於卵巢、宮頸等處，如輸卵管妊娠中存活的孕卵脫落在腹腔內，偶爾還在腹腔內臟器官如大網膜上繼續生長，則形成腹腔妊娠。如果是宮外孕的話，HCG的水平沒有宮內孕的值高，尿裡可能顯示不出來，出現假陰性結果，病人測後就會認為自己沒懷孕。很多忽視或根本不知道自己宮外孕的女性，往往由於大量的內出血而導致休克，甚至於危及生命。
若想確定是否懷孕，並且是不是宮外孕，最直接有效的方法就是去醫院做HCG和B超檢查。即使尿HCG呈陽性，也不能掉以輕心，因為還無法判斷是宮內孕還是宮外孕，這時需要做B超。如果B超也不能確診，還要查血HCG。
