1、從乙肝小三陽肝炎患者直接傳染獲得。這種情況在南歐地區很多，那裡的乙肝小三陽肝炎病毒水平較高，傳染性強;在我國卻非常少，因為病毒水平低，傳染性很弱。
2、原來是乙肝大三陽肝炎，沒有經過規範的抗病毒治療，或者治療失敗沒有改進方案後堅持治療，長期延誤，發展為病情很不穩定的乙肝小三陽肝炎。由乙肝大三陽肝炎延誤為乙肝小三陽肝炎的最多，病情要比乙肝大三陽肝炎複雜得多，治療要漫長得多，但許多患者反以為是好轉了，而掉以輕心，繼續延誤。
3、原來是乙肝大三陽肝炎，抗病毒治療有效，肝功正常，病毒陰性，乙肝大三陽也轉為乙肝小三陽，成為非活動性攜帶。乙肝大三陽肝炎如果是用普通干擾素治好的，至少有15%會復發;長效干擾素治好的，至少有5%會復發;用核苷類藥治好的過早停藥，絕大多數在長短不定的時期後會復發。復發後如果又逆轉為乙肝大三陽肝炎，要好治一些;但大多數成為乙肝小三陽肝炎，就麻煩了。
4、原來是乙肝小三陽攜帶，已經是乙肝病毒感染的恢復期。如果飲酒、服用傷肝藥物可以誘發肝炎;也可以沒有誘因就發生肝炎。這種來源的乙肝小三陽肝炎很少。
