對於大多數患者而言，這種轉化還需要其它輔助因子的存在，例如吸菸、化學物質、宿主因素(例如HIV感染)和環境協同因素等，均對非淋菌性尿道炎轉為惡性腫瘤有致突變及啟動作用。從臨床情況而言，非淋菌性尿道炎的癌變趨向可能與以下幾種因素有關：
1、免疫功能降低或身體衰弱時的人體易患非淋菌性尿道炎，而癌症的發生也與免疫功能有關，加上某些原因激活癌基因、免疫狀態改變和某些致癌物質作用，或皮損融合成片，長期不愈，形成潰瘍，浸潤糜爛，有繼發感染等慢性刺激，最終發生細胞突變而轉化為癌。
2、機體免疫功能下降，複發率高，採取多種有效治療措施，仍不能有效控制復發的皮損，可能向惡性化發展。
3、肛門、直腸及肛周等部位的巨大非淋菌性尿道炎是高度進展性腫瘤，具有復發和惡變特性，尤其是向皮膚深層浸潤生長時，惡變的可能性更大。
