非淋菌性尿道炎會導致如下的危害發生
1、併發其他病症：如急性附睪炎、前列腺炎、精囊炎、尿道腺炎、尿道周圍組織炎和膿腫、精囊炎、鞘膜積液、睪丸炎、結腸炎等，其中以附睪炎或前列腺炎居多。
2、誘發不孕不育症：非淋菌性尿道炎逆行感染，感染到男性前列腺、精囊腺和附睪。會使精子產生異常，患不育症。女性可以感染到宮頸、子宮內膜、輸卵管等等，引起不孕症。
3、引發排尿障礙：尿痛輕微，排尿時僅感到尿道灼熱或輕度刺痛，常可見終末血尿。患者常主訴尿道口紅腫、灼痛等，嚴重者甚至引發排尿障礙等重症。
4、導致性功能障礙：患了非淋菌性尿道炎如果沒有得到及時、科學地治療，久而久之，容易導致男性出現性慾減退、勃起不堅、陽痿、早洩及神經衰弱等症狀。
