為甚麼通過血液就能夠檢測出胎兒的性別呢? 其實這裡邊的原理並不複雜，在妊娠期，胎兒的少量DNA會進入母親的血液。而我們知道，人是由X和Y染色體決定性別的，而正常情況下，媽媽的染色體肯定是 XX。技術人員可以通過檢測母親血液中的DNA，如果發現有Y染色體上的片段，那麼就可以肯定這位媽媽懷的是男孩了，反之懷的就是女孩。
那麼，怎麼就能判定母親血液中胎兒的DNA是不是來自Y染色體呢?畢竟在母親的血液中，只有胎兒的遊離DNA，不能像在完整細胞中那樣，直接看到完整的Y染色體。好在，我們知道，Y染色體上有幾個DNA序列(SRY、DBY和TTTY2)，這些序列只在Y染色體上存在，如果在母親的血液中檢測到這些序列，就能證明胎兒是男的。
不過因為胎兒的DNA在母親的血液中含量很少，得獲得足夠的標誌著Y染色體的特徵DNA片段才能進行檢測，好在聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction PCR)能很容易地完成這項任務，因為PCR能夠對特定的DNA序列進行大量擴增，當在PCR反應後，將產物進行檢測，就能得出到底母親的血液中是否含有 Y染色體上的序列，也就知道胎兒的性別了。
