1)容易導致女性不孕:一旦卵巢囊腫變大或者變性，就有可能使精子、卵子或者受精卵不能正常運行，從而影響生育，導致不孕的惡果。另外先天性無卵巢、幼稚型卵巢、卵巢功能早衰、多囊卵巢、卵巢腫瘤等卵巢的疾病會影響卵巢的排卵功能，從而導致不孕。卵巢功能早期衰竭，女性過早絕經，會導致女性卵巢過早停止活動，從而導致不孕。
2)女性容顏早衰:卵巢囊腫會引發內分泌失調、早衰、惡變，甚至會引發卵巢癌。
3)引發流產、難產:卵巢囊腫在早孕時可能引起流產，中期妊娠時則易發生卵巢囊腫蒂扭轉，晚期妊娠時囊腫較大者可導致胎位異常，分娩時可能阻塞產道引起難產。
3)囊腫破裂、危及生命:當卵巢囊腫生長到一定大小，有可能出現併發症:感染、囊腫蒂扭轉、出血或破裂，危及女性生命。
