懷孕初期肚子疼並不一定會流產。在懷孕初期肚子疼且伴有不正常的陰道出血，還有腹部疼痛等症狀，可能是流產的徵兆。導致懷孕早期流產可能是胚胎本身有染色體或基因異常;也可能是孕媽媽患有糖尿病等自身免疫方面的疾病或是服用了某些藥物、抽菸、喝酒等。
懷孕初期肚子疼原因有：
懷孕初期肚子疼可能是因為子宮在長大，這種情況沒甚麼大礙。
女性常有反映酸、暖氣、上腹壓迫感等症狀，是由於子宮增大造成胃部受壓的結果。再加上孕期胃腸蠕動減弱，胃部肌肉張力低，尤其胃賁門部括約肌鬆弛，致胃內容物倒流到食道下段，食道粘膜受到刺激而產生胃區燒灼感。
還可能由於子宮增大及盆腔充血，會因子宮旁的韌帶受到增大子宮的影響，而產生下腹尤其是近兩側大腿根部也就是腹股溝附近的酸脹隱痛感，懷孕初期肚子疼一般不嚴重及不影響到妊娠的正常發展。如果有宮頸炎及慢性闌尾炎病史的，盆腔充血癥狀對炎症部位的刺激影響也會產生這樣的不適感。
