卡介苗接種是安全的，但為慎重起見，對有免疫缺陷病、惡性疾病如腫瘤、白血病等而致的免疫功能低下，以及使用腎上腺皮質激素等免疫抑制劑治療的患者應禁忌接種，接種卡介苗時對有以下情況的孩子應暫緩接種或慎重從事：
1、發熱、腹瀉等急性傳染病的的寶寶。
2、患有嚴重急性症狀及免疫功能不全的寶寶。
3、早產、難產、伴有明顯的先天性畸形的寶寶。
4、新生寶寶體重低於2500公克。
5、可疑之結核病患，勿直接接種卡介苗，應先做結核菌素測驗。
6、心、肺、腎等慢性疾病、嚴重皮膚病、過敏性皮膚病、神經系統疾病的患者、以及對預防接種有過敏反應。
7、患有嚴重溼疹的寶寶。
