子宮輸卵管造影術是檢查輸卵管堵塞的最可靠方法之一，準確率可達95%以上。但由於X線照射的影響及技術操作不規範造成診斷失誤及錯誤等，也會造成一些併發症。
1、輸卵管穿孔
輸卵管穿孔多發生於輸卵管內膜病變嚴重，粘連緊密的情況下，穿孔率為3%左右，一般由於穿孔直徑甚小，多為0.038cm的導絲所致，一般無明顯的臨床症狀，無需特別處理。
2、輸卵管妊娠
除輸卵管近端梗阻外，其遠端亦有病變，輸卵管再通術後宮外孕的發生率約為5%～13%，病變均在壺腹部，遠離再通部位。對再通術的妊娠應予以密切監測，早期診斷宮外孕，以採取有效的保守治療。
3、再次梗阻
妊娠多發生於術後第6～12月，若1年仍未懷孕，50%應考慮再次梗阻，梗阻的原因可能是輸卵管內重新出現了與前類似的病變。
另外，普通的子宮輸卵管造影檢查時，病人所接受的放射劑量經陰道測量為對患者的生育功能和胎兒的正常發育可能也會造成影響，輸卵管堵塞患者進行手術之後若半年未能妊娠，還應考慮是否存在盆腔病變，應及時行腹腔鏡檢查。
