1.反覆發作的冠周炎：阻生的智齒牙冠周圍軟組織與牙齒之間形成一盲袋，引起食物、細菌的積存，抵抗力下降時，出現冠周炎是必然的。一般的消炎治療治標不治本，因此冠周炎會反覆發作。常表現為冠周組織紅腫疼痛，以致影響咀嚼，吞嚥， 還常伴有張口困難及發燒，林巴結腫大等全身症狀。若炎症未及時控制，還可向頜周、頸部擴散，形成組織間感染、頜骨骨髓炎，甚至還可發生敗血症、心包炎等嚴重全身併發症另外，智齒萌出如空間不夠還易造成前牙擁擠，影響美觀，此時，拔除智齒是最好辦法。
2.齲齒：位置不正的智齒與第二磨牙之間容易積存食物殘渣，而且不易清潔，一般數月可形成齲齒，直接破壞牙體組織。
3.下頜疼痛、磨牙：阻生的智齒往往不能與對頜牙齒建立正常的咬合關係，長時間可導致顳下頜關節彈響、張口疼痛，夜磨牙等症狀，對輕壯年的身心健康影響較大。
4.引發三叉神經痛：有證據表明一些阻生智齒是某些三叉神經痛的病灶所在。
5.牙列不齊：14-18歲是智齒萌生的最活躍時期，但因頜骨骨量與牙量間的不平衡，可供智齒萌出的空間是有限的。因此，智齒萌出運動的推動力常是造成牙齒擁擠和排列不整齊的主要原因之一。這種萌出運動的持續推動力只要有4～5克，就足以對第二磨牙產生影響。因此，第二磨牙發生錯位，扭轉等較為多見，約佔牙頜畸形患者的20%左右，其中約有80%發生在下頜第二磨牙;以青少年居多，女性約是男性的1.6倍，第二磨牙的錯位，會使上下方的咬 頜接觸面積減少，人的咀嚼功能明顯降低。
6.鄰牙及支持組織的吸收：下頜智齒的牙胚在發育過程中，牙的長軸本來是向前方傾斜的，只是在有足夠下頜發育時才逐漸直立萌出，當萌出過程中受阻於第二磨牙時，該處就會產生附著第二磨牙牙根表面的毀齒細胞。毀齒細胞可釋放出溶蛋白酶而使牙根逐漸吸收，嚴重者可使下頜第二磨牙遠中牙根完全吸收。而且阻生智齒與第二磨牙間常存在的慢性牙周炎也會造成牙槽骨的炎症性吸收。
7.顱下頜紊亂症：下頜智齒的阻生或錯位常會與上頜第二磨牙發生咬頜干擾而導致下頜病理性後縮，這是誘發顱下頜紊亂症的原因之一。臨床主要表現為顳下頜關節的彈響、疼痛和下頜運動的異常，咀嚼肌的疼痛、耳鳴、舌痛等症狀。許多患者在拔除阻生或錯位的智齒後，由於阻斷了誘發顱下頜紊亂的潛在因素而取得了明顯療效。
8.智齒周圍囊性病變：頜骨的牙源性囊性病變好發於未萌出的埋伏牙，而下頜智齒萌出受阻的機率又最高，顯然是主要的好發部位，當囊腫發展到一定程度度，頜骨可發生膨隆變形，遇有繼發感染，還會反覆腫痛，嚴重者還可造成病理性骨折。
9.口腔粘膜發生癌前病損：阻生和錯位智齒的牙齦和頰粘膜，可因牙冠邊緣的長期機械刺激或反覆咬傷，而使粘膜發生潰瘍、糜爛、組織異常增生及白斑等病理損害。如此長期的創傷修復再創傷過程會影響口腔粘膜上皮的正常角化而發生癌前病損，進而誘發口腔粘膜癌變。
智齒在頜骨內由於位置不正導致容納牙齒的頜骨不斷退化變小，因而智齒阻生是必然的結果。拔除阻生的智齒對咀嚼、語言等功能無任何不良影響，加之拔除是治療阻生的最有效的辦法，因此，建議儘早、果斷地拔除引起上述危害的阻生智齒。
