如果男性禁慾時間較長,恢復性生活時,會出現精子發黃的現象。排精時間間隔太長,精液中的成份就會發生生理性的變化,就會使得精子發黃,並且此時的精液粘稠度比較高,這就使得精液的活動能力受到了限制 。但是這種情況下會隨著性生活的展開而逐漸好轉。
如果男性的精液持續發黃,那麼問題就比較嚴重。這是由於生殖系統感染造成的,最常見的疾病就是前列腺炎和精囊炎。
精子畸形症可能也是精液發黃的原因之一。精液中畸形精子超過20%,畸形精子包括頭,體、尾的形態異常,或頭體混合畸形。精液發黃的原因中還有一部分是精子凝集症。由於存在精子抗體,導致精子自身凝集,通過精子凝集試驗和性交後試驗均見精子凝集者為精子凝集症,精液發黃的原因須與精液不液化症相鑑別。