金黃色葡萄球菌在自然界中無處不在，空氣、水、灰塵及人和動物的排洩物中都可找到。因此，食品受到汙染的機會很多。美國疾病控制中心報告，由金黃色葡萄球菌引起的感染佔第二位，僅次於大腸桿菌。金黃色葡萄球菌腸毒素是個世界性衛生難題，在美國由金黃色葡萄球菌腸毒素引起的食物中毒，佔整個細菌性食物中毒的 33%，加拿大則更多，佔到45%，中國金黃色葡萄球菌引起的食物中毒事件也時有發生，比如2001年4月12日，無錫市錫山區所轄小學、幼兒園因課間加餐飲用袋裝牛奶飲料導致食物中毒事件 。
金黃色葡萄球菌的流行病學一般有如下特點：季節分佈，多見於春夏季;中毒食品種類多，如奶、肉、蛋、魚及其製品。此外，剩飯、油煎蛋、糯米糕及涼粉等引起的中毒事件也有報道。上呼吸道感染患者鼻腔帶菌率83%，所以人畜化膿性感染部位，常成為汙染源。
金黃色葡萄球菌是人類化膿感染中最常見的病原菌，可引起局部化膿感染，也可引起肺炎、偽膜性腸炎、心包炎等，甚至敗血症、膿毒症等全身感染。金黃色葡萄球菌的致病力強弱主要取決於其產生的毒素和侵襲性酶：
a.溶血毒素：外毒素，分α、β、γ、δ四種，能損傷血小板，破壞溶酶體，引起肌體局部缺血和壞死
b.殺死白細胞素：可破壞人的白細胞和巨噬細胞
c.血漿凝固酶：當金黃色葡萄球菌侵入人體時，該酶使血液或血漿中的纖維蛋白沉積於菌體表面或凝固，阻礙吞噬細胞的吞噬作用。葡萄球菌形成的感染易局部化與此酶有關
d.脫氧核糖核酸酶：金黃色葡萄球菌產生的脫氧核糖核酸酶能耐受高溫，可用來作為依據鑑定金黃色葡萄球菌
e. 腸毒素：金黃色葡萄球菌能產生數種引起急性胃腸炎的蛋白質性腸毒素，分為A、B、C1、C2、C3、D、E及F八種血清型。腸毒素可耐受100°C煮沸 30分鐘而不被破壞。它引起的食物中毒症狀是嘔吐和腹瀉。此外，金黃色葡萄球菌還產生溶表皮素、明膠酶、蛋白酶、脂肪酶、肽酶等。
f .表皮剝脫毒素：引起燙傷樣皮膚綜合徵，又稱剝脫樣皮炎。
g.毒性休克綜合徵毒素(tsst-1)
