1.囊腫穿刺抽液術 在B型超聲監控引導下經皮囊腫穿刺，抽盡囊液。此法操作簡單，可重複穿刺或穿刺後置管。穿刺前須除外肝包蟲囊腫後方可實施。應嚴格無菌技術，避免囊內出血及膿腫形成。
2.囊腫摘除術 容易剝離的單發性囊腫可採用此種手術，治療較徹底。
3.囊腫“開窗”術 用於囊腫位於肝的淺層且無感染或膽管與囊腫無交通的情況。切除部分囊腫頂壁即“開窗”，吸淨囊液，使囊腔向腹腔內開放。若囊腫併發感染或囊 內有陳舊性出血時，開窗後清理囊腔，並將部分帶蒂大網膜填塞囊腔，腹腔內“菸捲”引流。若囊液染有膽汁時，清理囊腔，確定無繼續漏膽後，按上述方法行大網 膜堵塞囊腔。
4.囊腫內引流術 用於囊腔內有溢漏膽汁又不易找出膽管開口或囊壁較堅厚及感染嚴重的囊腫。
5.非典型肝部分切除並用囊腫“開窗”術 瀰漫性肝囊腫某一葉囊腫密集、壓迫致使該葉肝實質明顯萎縮，可行非典型部分切除術，而其餘肝囊腫並用“開窗”術。
6.囊腫外引流術
囊腫感染而又不易耐受其它較複雜手術時，可行暫時性外引流術，但易形成長期不愈的外瘻，往往需二期手術。
