首先，要在患處的肌肉注射鎮痛劑，麻醉30分鐘後開始治療。
然後，患者需仰臥位，醫生開始清潔治療區皮膚，進行消毒，保護眼睛。
其次，主治醫生開動調Q脈衝激光(美膚激光)，並調整能量、焦點、頻率以符合患者的實際情況。
再然後，再次調整好的脈衝激光，對準青色胎記治療區皮膚，緩慢、均勻、密集、逐點擊打，至皮膚髮白、淤血、滲血。激光擊打在胎記上時，患者僅有輕微的熱刺感。
最後，青色胎記的治療結束後，待其皮膚淤血乾燥，方可進行包紮。一日後拆除包紮的紗布。青色胎記治療術後次日即可見紅色滲血處乾燥成黑色血痂，並出現不同程度的腫脹。
而青色胎記治療全程需要治療的次數，與黑素細胞生長的部位深淺、顏色深淺成正比;顏色越深，往往青色胎記的治療次數就越多，青色胎記的治療通常需4～8次左右的治療，每次治療需間隔約3個月以上。以後每次的治療過程基本相同，隨著治療次數增多，未清除完全的皮膚面積越來越小，治療區會逐漸縮小，損傷也會逐漸減輕。
