根據流行病學資料，臨床表現和實驗室檢查結果可作出診斷。
(一)流行病學 包括流行地區，流行季節，與鼠類直接和間接接觸史，進入疫區或兩個月以內有疫區居住史。
(二)臨床表現 起病急，發熱，頭痛，眼眶痛，腰痛，口渴，嘔吐，酒醉貌，球結膜水腫，充血，出血，軟顎，腋下有出血點，肋椎角有叩擊痛。
(三)實驗室檢查
1.一般實驗室檢查 血象白細胞總數增高，分類中淋巴細胞增多，並有異常淋巴細胞，血小板數下降，尿檢有蛋白，紅細胞，白細胞，管型等。
2.特異性實驗診斷 近年來應用血清學方法檢測有助於病人早期診斷，對臨床不典型的病人尤有助於診斷，檢測方法有間接免疫熒光試驗，酶聯免疫吸附試驗，酶標SPA組化試驗，血 凝抑制試驗，免疫粘附血凝試驗，固相免疫血球吸附試驗及固相放射免疫試驗等，特異性IgM陽性或發病早期和恢復期兩次血清特異性IgG抗體效價遞增4倍以 上，均有確診價值，從病人血液或尿中分離到病毒或檢出病毒抗原亦可確診，近有采用多聚酶鏈反應(PCR)直接檢測病毒抗原，有助於病原診斷。
鑑別診斷
發熱期應與上呼吸道感染，流行性感冒，敗血症，傷寒，鉤端螺旋體病，急性胃腸炎和菌痢等鑑別，有皮膚出血斑者應與血小板減少性紫癜區別，蛋白尿應與急性腎盂腎炎，急性腎小球腎炎相區別，腹痛應與急性闌尾炎，急性膽囊炎相區別，消化道出血應與潰瘍病出血相區別，咯血應與支氣管擴張，肺結核咯血相區別，休克期應與其他感染性休克鑑別，少尿期則與急性腎炎及其他原因引起的急性腎衰竭相鑑別，出血明顯者需與消化性潰瘍出血，血小板減少性紫癜和其他原因所致DIC鑑別，本病有典型臨床表現和獨特的病期經過，以及血清學檢測等，均有助於鑑別。
