1、感染(最常見)：細菌、病毒、寄生蟲等病原體的感染。
2、過食性腹瀉：過食性腹瀉是由於一次或長期超量餵食造成嬰幼兒胃腸道負擔過重，以致食物在胃腸內消化吸收障礙而出現的腹瀉。
3、腸道本身的疾病，如腸炎和腸套疊。
4、情緒及功能的異常，如激燥性大腸症候群。
5、吃抗生素時，也是導致腹瀉的因素。
6、腸道本身有功能或機械性異常，如開刀後的腸段短小症候群等。
7、感冒或泌尿道發炎也會引起腹瀉。
8、腸道外分泌腺的異常，如膽道閉鎖、慢性胰臟炎等。
9、營養不良、免疫機能障礙、重金屬中毒、藥物中毒、腫瘤等。
10、乳糖過敏、輔食添加過快過早、食物過敏和脂肪攝入過多等。
