據統計，80%～90% 的口臭是來源於口腔。口腔中有未治療的齲齒、殘根、殘冠、不良修復體、不正常解剖結構、牙齦炎、牙周炎及口腔粘膜病等都可以引起口臭。其中齲齒和牙周疾病又是最常見的相關疾病。深齲窩洞內、不良修復體懸突下常殘存食物殘渣和菌斑，細菌經過發酵分解，產生臭味。牙髓壞死或化膿性牙髓炎，未經治療也可發出臭味;牙周病患者常伴有大量的牙石、菌斑，牙周袋內細菌發酵產生硫化氫、吲哚和氨類，因而產生臭味。另外，牙周膿腫和牙周袋溢膿，多為金黃色葡萄球菌合併牙周致病菌感染，也會發出臭味。唾液的質和量也起到重要作用。唾液量的減少、 蛋白質等有機成分的增多降低了唾液的沖刷作用和緩衝作用, 使細菌大量繁殖,分解唾液、 齦溝液及食物殘渣中的有機成分, 產生大量的揮發性硫化物、 吲哚等物質,引起口臭。
口臭的發病原因
非口源性口臭
口腔鄰近組織疾病如化膿性扁桃體炎、慢性上頜竇炎、萎縮性鼻炎等，可產生膿性分泌物而發出臭味;臨床上常見的內科疾病如急慢性胃炎、消化性潰瘍出現酸臭味;幽門梗阻、晚期胃癌常出現臭鴨蛋性口臭;糖尿病酮症酸中毒患者可呼出丙酮味氣體，尿毒症患者呼出爛蘋果氣味。另外白血病、維生素缺乏、重金屬中毒等疾病均可引起的口臭。
生理性口臭
飢餓、食用了某些藥物或洋蔥、大蒜等刺激性食物、抽菸、睡眠時唾液分泌量減少所致的細菌大量分解食物殘渣等都可能引起短暫的口臭。而健康人的口臭可能由於不良的口腔習慣和口腔衛生造成舌背的菌斑增多、增厚所引起。由於舌背的表面積大，有許多乳頭、溝裂和凹陷，有利於細菌、口腔粘膜脫落上皮、食物殘渣等的滯留，充當“細菌儲藏室”，有利於口臭的產生。有研究表明，口臭程度、揮發性硫化物的量與舌苔厚度及面積均存在正相關關係，其中與舌苔厚度的關係更為密切，清除舌苔後揮發性硫化物減少。這可能因為舌苔越厚，越易形成厭氧環境，越利於厭氧菌的生長，從而也越利於揮發性硫化物的產生，導致口臭。
除此之外，還有假性口臭，即患者本人自我感覺有口腔異味，但檢查結果為陰性。可通過解釋說明和心理諮詢得到改善者。
