(1)腦損傷綜合徵:如腦炎,腦外傷,腦血管病,一氧化碳中毒等病變的恢復期可以有類似表現,但常伴有智力損害,肢體癱瘓,神經麻痺,腦CT或腦電圖異常可幫助鑑別。
(2)焦慮症:焦慮症多發生於中青年群體中,誘發的因素主要與人的個性和環境有關,雖然也有心慌,氣短,消化不良,噁心嘔吐,腹脹便秘,出汗,肢體震顫,遺精,陽痿,月經不調等症狀,但與神經官能症不同的是病史比較短,而且可以詢問出導致焦慮的原因。
(3)甲狀腺機能亢進:患有甲亢的患者有類似神經官能症的表現,但通過臨床體檢化驗可以發現一些甲亢特有體徵,如眼球突出,雙手細震顫,甲狀腺輕度腫大,血中T3,T4增高等可資鑑別。