臨床診斷兒童慢性咳嗽時應充分考慮年齡因素，不同年齡病因不同。
1.常見病因
(1)呼吸道感染與感染後咳嗽
1)呼吸道感染 許多病原微生物如百日咳桿菌、結核桿菌、病毒(特別是呼吸道合胞病毒、副流感病毒、鉅細胞包涵體病毒)、肺炎支原體、衣原體等引起的呼吸道感染是兒童慢性咳嗽常見的原因，多見於<5歲的學齡前兒童。
2)感染後咳嗽 急性呼吸道感染，咳嗽症狀持續超過4周可考慮感染後咳嗽。其機制可能是感染引致氣道上皮的完整性受到破壞和(或)纖毛柱狀上皮細胞的鱗狀化生和(或)持續的氣道炎症伴有暫時的氣道高反應性。感染後咳嗽的臨床特徵和診斷線索有：①近期有明確的呼吸道感染史;②咳嗽呈刺激性乾咳或伴少量白色黏痰;③胸X線片檢查無異常;④肺通氣功能正常;⑤咳嗽通常具有自限性;⑥除外引起慢性咳嗽的其他原因。如果咳嗽時間超過8周，應考慮其他診斷。
(2)咳嗽變異性哮喘(CVA)
CVA是引起兒童尤其是學齡前和學齡期兒童慢性咳嗽的常見原因之一。CVA的臨床特徵和診斷線索有：①持續咳嗽>4周，常在夜間和(或)清晨發作，運動、遇冷空氣後咳嗽加重，臨床上無感染徵象或經過較長時間抗生素治療無效;②支氣管擴張劑診斷性治療可使咳嗽症狀明顯緩解;③肺通氣功能正常，支氣管激發試驗提示氣道高反應性;④有過敏性疾病史包括藥物過敏史，以及過敏性疾病陽性家族史。過敏原檢測陽性可輔助診斷;⑤除外其他疾病引起的慢性咳嗽。
(3)上氣道咳嗽綜合徵(UACS)
各種鼻炎(過敏性及非過敏性)、鼻竇炎、慢性咽炎、慢性扁桃體炎、鼻息肉、腺樣體肥大等上氣道疾病可引起慢性咳嗽，既往診斷為鼻後滴漏(流)綜合徵(PNDs)，意即鼻腔分泌物通過鼻後孔向咽部倒流引起的咳嗽。臨床特點和診斷線索有：①慢性咳嗽伴或不伴咳痰，咳嗽以清晨或體位改變時為甚，常伴有鼻塞、流涕、咽乾並有異物感、反覆清咽、有咽後壁黏液附著感，少數患兒訴有頭痛，頭暈、低熱等;②檢查鼻竇區可有壓痛，鼻竇開口處可有黃白色分泌物流出，咽後壁濾泡明顯增生，呈鵝卵石樣，有時可見咽後壁黏液樣物附著;③針對性治療如抗組胺藥和白三烯受體拮抗劑，鼻用糖皮質激素等有效;④鼻竇炎所致者，鼻竇X線平片或CT片可見相應改變。
(4)胃食管反流性咳嗽(GERC)
胃食管反流(GER)在嬰幼兒期是一種生理現象。健康嬰兒GER發生率為40%～65%，1～4個月達高峰，1歲時多自然緩解。當引起症狀和(或)伴有胃食管功能紊亂時就成為疾病即胃食管反流病(GERD)。GERC的臨床特徵和診斷線索有：①陣發性咳嗽，有時劇咳，多發生於夜間;②症狀大多出現在飲食後，餵養困難。部分患兒伴有上腹部或劍突下不適、胸骨後燒灼感、胸痛、咽痛等;③嬰兒除引起咳嗽外，還可致窒息、心動過緩和背部呈弓形;④可導致患兒生長髮育停滯或延遲。
(5)嗜酸粒細胞性支氣管炎(EB)
EB的臨床特徵和診斷線索有：①慢性刺激性咳嗽;②胸X線片正常;③肺通氣功能正常，無氣道高反應性;④痰液中嗜酸粒細胞相對百分數>3%;⑤口服或吸人糖皮質激素治療有效。
(6)先天性呼吸道疾病
主要見於嬰幼兒，尤其是1歲以內。包括有先天性氣管食管瘻、先天性血管畸形壓迫氣道、喉氣管支氣管軟化和(或)狹窄、支氣管肺囊腫、纖毛運動障礙、縱隔腫瘤等。
(7)心因性咳嗽
心因性咳嗽的臨床特徵和診斷線索有：①年長兒多見;②日間咳嗽為主，專注於某件事情或夜間休息時咳嗽消失;③常伴有焦慮症狀;⑤不伴有器質性疾病，併除外引起慢性咳嗽的其他原因。
