對於扁桃體炎的治療，主要是抗生素的治療，同時服用大量維生素C等;也可以用中醫中藥治療;如果扁桃體炎反覆發作，為了避免引起嚴重的併發症，建議在扁桃體炎炎症控制之後，將其切除。
藥物治療
傳統藥物治療急性扁桃體炎的方式一般是採用抗菌消炎藥治療，這種局部治療方式的缺點在於只消炎，而不能清除扁桃體陷窩內的細菌，一旦身體抵抗力降低極易反覆發作，日久則形成慢性病灶。
手術治療
如果扁桃體炎非常嚴重而且經常發作，使得孩子的全身性健康都受到影響，或是妨礙到了孩子上學、聽力或呼[1]吸，醫生會建議用外科手術將扁桃體切除(扁桃體切除術)。不過，大多數醫生會在別無他法可想時，才會建議實施這種手術。
孩子必須住院接受這種手術，在手術時還要作全身性麻醉。手術的危險性很小，這種手術可以一勞永逸地解決扁桃體炎的問題。
患兒有以下情況方可考慮體切除：
1、化膿扁桃體炎反覆發作，曾患扁桃體周圍膿腫，炎症波及鄰近器官，經常發生中耳炎及頸淋巴結炎，扁桃體上常見酪狀分泌物，患兒口臭不適;
2、扁桃體重度肥大，妨礙呼吸、吞嚥和發音，入睡打鼾、睡眠不安;
3、慢性扁桃體炎引起風溼熱、腎炎等疾病;
4、慢性扁桃體炎引起長期低熱、食慾減退、影響孩子的生長髮育。
