扁桃體炎的症狀一般為扁桃體充血、腫脹、化膿。扁桃體的陷窩上出現許多小膿栓，嚴重的會佈滿膿苔。經常反覆發炎可形成慢性扁桃體炎，由於反覆炎症使扁桃體增生肥大，兩側扁桃體幾乎碰在一起，像兩扇大門堵住了咽部。
扁桃體炎的危害還不止這些，它一旦成為病灶，細菌就會在這裡繁殖，併產生毒素，隨血液進入人體，使人體發生免疫反應，而這種免疫反應是一種異常的過敏狀態，可以進一步導致不少重要臟器得病，如急性腎炎、風溼病等，這些併發症的危害遠遠超過扁桃體炎本身的危害。
小兒患扁桃體炎時全身的感染症狀很明顯，孩子表現為：高燒可達39～40℃，同時伴有寒戰，全身乏力，頭痛及全身痛，食慾不振，噁心和嘔吐。檢查咽部時可發現扁桃體上有膿。這是最有力的診斷依據，因為光憑全身症狀不能與其他感冒相區別。慢性扁桃體炎引起的扁桃體肥大可造成呼吸困難，特別是睡眠時，因舌頭也鬆弛後倒，致使鼾聲如雷，天長日久會因慢性缺氧而影響生長髮育，慢性缺氧還會使孩子的智力發育受到影響。
