新生兒溶血癥、新生兒感染、膽道畸形、新生兒肝炎等疾病是病理性黃疸最常見的原因。不管是那種疾病能夠引起的，病理性黃疸嚴重時很可能發展為對新生兒神經系統產生損傷甚至可以致死的“核黃疸”，一定要加強預防和治療。
1、某些原因(先天性代謝酶和紅細胞遺傳性缺陷)以及理化、生物及免疫因素所致的體內紅細胞破壞過多，發生貧血、溶血，使血內膽紅素原料過剩，均可造成肝前性黃疸。如自身免疫性溶血性貧血、遺傳性球形紅細胞增多症、不穩定血紅蛋白病等。
2、由於結石和肝、膽、胰腫瘤以及其他炎症，致使膽道梗阻，膽汁不能排入小腸，就可造成肝後性黃疸。常見疾病包括：化膿性膽管炎、膽總管結石、胰頭癌、胰腺炎、膽管或膽囊癌。
3、先天性非溶血性黃疸：吉爾伯特(Gilbert)病及Dubin-Johnson二氏綜合徵引起的黃疸和新生黴素引起的黃疸，都是肝細胞內膽紅素結合障礙、膽紅素代謝功能缺陷所造成的。
4、嚴重心臟病患者心務衰竭時，肝臟長期淤血腫大，可以發生黃疸。
5、藥物性損害。有服藥史、服用氯丙嗪、吲哚美辛(消炎痛)、苯巴比妥類、磺胺類、對氨水楊酸、卡巴胂等，可至中毒性肝炎。此時胃腸道症狀不明顯，黃疸出現之前無發熱，血清轉氨酶升高很明顯，但絮濁反應正常等可資鑑別。
