扁平疣不是扁平溼疣，扁平溼疣(Condyloma flant)為二期梅毒疹，發生於生殖器和肛門等處。一般有三種，即單純性、潰瘍性和肥大性，起初損害為集蔟性紅色柔軟、扁平的丘疹。由於某些刺激後，扁平丘疹可呈灰褐色。有時類似疣體呈扁平斑塊狀的尖銳溼疣可融合成斑片狀，無蒂，呈扁平匐進性擴展(單純性)。也可增殖融合成肥厚性斑快，高低不平，觸之堅實，比較平滑(肥厚性)。可因局部潮溼、摩擦等使表面有分泌物、糜爛，甚至形成潰瘍(潰瘍性)。這種發生在皮膚粘膜的特殊類型的二期梅毒診，需與尖銳溼疣鑑別，但扁平尖銳溼疣皮疹內發現大量梅毒螺旋體，傳染性較大。USR、VDRL、TPL等化驗陽性，而尖銳溼疣陰性。臨床上有時壓緊的尖銳溼疣團快類似扁平溼疣，用棉籤將其撥開即可見明顯分開的乳頭狀疣體，仔細觀察即可區別。
根據最新的《阿克曼外科病理學》，扁平溼疣被認為與尖銳溼疣一樣，同為HPV感染引起的皮膚病變，而且《阿克曼外科病理學》隨後嚴肅的指出，要嚴格的區分扁平溼疣和梅毒溼疣，這是兩個完全不同的概念。
