1、預防秋季腹瀉主要應防止著涼，尤其要防止疲勞後著涼，因為疲勞使身體免疫力下降，小兒因消化系統發育還不成熟，特別是腹壁及腸道缺乏脂肪“保暖層”，因而容易受較涼空氣的刺激而引起腸蠕動增加，導致便次增加和腸道水分吸收減少，大便稀溏，病毒也容易乘虛而入，造成秋季腹瀉。
2、預防小兒秋季腹瀉應注意飲食及餵養，最好以母乳餵養，尤其在嬰兒出生後的最初幾個月及第一個夏季最為重要，儘量避免夏季斷奶;注意飲食衛生，防止病從口入;合理餵養、定時定量，按時添加輔食，切忌幾種輔食一起添加;食慾不振或發熱早期，應減少小兒的奶量及其它食物，並以糖鹽水代替，減輕胃腸道的負擔，避免過食或喂富有脂肪的食物。
3、不要帶小兒到人多的公共場所去，避免接觸病兒。小兒使用的玩具，和能夠觸摸到的傢俱，要勤用清水沖洗，吃東西前一定要洗手，家長在為孩子吃奶或吃飯前也要把手洗乾淨，要用流動水沖洗。
4、加強小兒體格鍛鍊，增強小兒體質。及早治療小兒的營養不良、佝僂病等一些易致慢性腹瀉的疾病，同時要加強護理;不要長期應用廣譜抗生素，以避免腸道內正常菌群的失調;也可到各防疫站接種疫苗。
