因為腹瀉的病因十分複雜，因此遇到腹瀉的病人應按照其腹瀉的特點及伴隨的症狀，儘早確立腹瀉的類型，即病人是分泌性腹瀉，還是高滲性腹瀉、吸收不良性腹瀉抑或胃腸運動功能障礙性腹瀉;其次，還應判斷病人是急性腹瀉還是慢性腹瀉，對指導治療都至關重要。病因治療
1.抗感染治療按照不同病因，選用對應的抗生素，
2.其他如乳糖不耐受症不可以用乳製品，成人乳糜瀉應禁食麥類製品。慢性胰腺炎可補充多種消化酶。藥物相關性腹瀉應立即停用有關藥物。
3.通常治療糾正水、電解質、酸鹼平衡紊亂和營養失衡。酌情補充液體，補充維生素、氨基酸、脂肪乳劑等營養物質，
4.黏膜保護劑雙八面體蒙脫石、硫糖鋁等，
5.微生態製劑如雙歧桿菌可以調節腸道菌群，
6.止瀉劑按照具體狀況選用對應止瀉劑
