變性手術為整形外科之最，這一點也不過分。首先，患者要以虛擬轉換的性別角色生活1年以上，包括衣著、舉止、生活習慣等等，以便於手術後在最短的時間內實現角色轉換，融入新生活。同時，還要服用激素藥品。至於手術過程，那就更加複雜了。
作為“男變女”來說，先要切掉睪丸、陰莖、陰囊等器官，再製造陰道、陰唇、陰蒂等女性器官，然後再依次做隆胸、喉結縮小、磨骨、脫毛等手術，有的還需做喉腔手術，逐步形成女
變性手術性特徵。“女變男”還要複雜一些。手術過程與“男變女”相對應，關鍵是陰莖再造不易成功，稍有不慎就會失敗，造成終生遺憾，甚至危及患者生命。
不管是“男變女”還是“女變男”，由於手術程序多，手術時間長，一般手術所要承擔的風險在變性手術中陡增許多。再者，手術的費用也是一個需要面對的問題。由於患者的身體狀況不一，變性的具體要求不同，手術程序和所用材料也有較大差異。比如，同樣是隆胸，一般性材料幾千元，而好的材料則達一兩萬。再比如，有些患者考慮到保密，要求住賓館式的單人間，費用肯定要增大。就一般情況而言，“女變男”應該在4萬元上下，“男變女”則應在3萬元左右。不過，這是西安地區正規醫院的收費，如果在一些非正規醫療單位或北京、上海等外地大城市做，費用則會成倍翻番，有的要達到十幾萬元甚至20萬元。
