症狀一：肛內尖銳溼疣經常會有肛門內脹痛感、有想排便、痢疾後重感、同時還會有大便帶血，便血，大便不暢。這些症狀由於個人差異未必會全都出現，但是如果出現2項以上，同時又有過肛交或者近期痔瘡頻繁發作的患者，應該及時去醫院做檢查。
症狀二：肛內尖銳溼疣表面凹凸不平，形成針刺狀、乳頭狀、菜花狀、雞冠狀等，外觀疣狀，贅生物、大小不等。表面有滲液觸之處血。並無臭味，一般無自覺症狀，感染時出現瘙癢、疼痛、異物感、下墜感、肛周分泌物。
症狀三：肛內尖銳溼疣初起呈絨毛狀，散在小乳頭，在粘膜多為溼性溼疣，在外面多為乾性溼疣。溼性溼疣呈淡粉紅色，而乾性溼疣則呈褐色或灰色。
痔瘡經常發作、大便乾燥、有肛交行為，肛內尖銳溼疣發生的幾率會比普通患者高一些。痔瘡的發作會降低局部皮膚的抗菌能力，增加尖銳溼疣的感染機會。
