黴菌性陰道炎的治療並不困難，關鍵是要徹底治癒，避免反覆發作。
①可選用2%~4%的碳酸氫鈉(即小蘇打)液沖洗外陰及陰道，每日1次，10次為一療程，目的是為了造成不利於念珠菌生存的鹼性環境。
②在沖洗後可選用制黴菌素10萬~20萬單位(粉劑、栓劑或軟膏均可)放入陰道，每晚1次，10~14天為一療程;外陰部塗3%克黴唑軟膏，每日1次，效果也很好。
③應勤換內褲、用過的內褲、盆及毛巾均應用開水煮沸30分鐘或飽和鹽水浸泡1~4小時消毒，因為念珠菌對熱的抵抗力差，加熱至60℃，1小時即可死亡。
久治不愈時應到醫院檢查血糖、尿糖以排除糖尿病;還應檢查有無滴蟲感染，因為本病有時與滴蟲性陰道炎併發;長期大量服用皮質激素及長期服用廣譜抗生素者應停藥;為防止腸道念珠菌的感染，同時可口服制黴菌素50萬~100萬單位，每日3次，7~10天為一療程，以消滅腸道念珠菌(因制黴菌素腸道不吸收)。若其他部位受黴菌感染時，可內服斯皮仁諾，每次 100~200毫克，每日2次，共服1~3天;重症者可服5天，甚至5天以上，一般不宜超過7天。
中藥：外陰奇癢時，可撒冰硼散，也可用青黛、黃連、馬牙硝等量共為細末，加甘油少許攪勻，用棉棒蘸塗外陰、陰道，每日早晚各1次。
另一常用驗方：苦參30克，蛇床子30克，川椒30克，枯礬30克，百部30克，藿香15克，朴硝30克，硼吵30克，煎湯/2000毫升放入消黴器中，灌洗陰道，每日1次，重症者2次。10次為一療程。
黴菌性陰道炎反覆發作注意事項：
第一，發生黴菌性陰道炎後用藥不認真，不能徹底治療，是導致疾病反得發作的重要原因;
第二，夫妻雙方未同時接受治療;
第三，治療期間未按規定洗消毒內褲、毛巾、。
第四，存在於腸道中的念珠菌感染陰道時即能引起黴菌性陰道炎。
第五，經常或長期使用抗生素;
第六，糖尿病患者容易反覆發作黴菌性陰道炎;
第七，不講究衛生，內褲與襪子同洗。一定要從這幾方面做好預防的工作。
