過敏性咳嗽病的發病原因錯綜複雜，但主要包括兩個方面，即過敏性咳嗽病患者的體質和環境因素。患者的體質包括“遺傳素質”、免疫狀態、精神心理狀態、內分泌和健康狀況等主觀條件，是患者易感過敏性咳嗽的重要因素。環境因素包括各種變應原、刺激性氣體、病毒感染、居住的地區、居室的條件、職業因素、氣候、藥物、運動(過度通氣)、食物以及食物添加劑、飲食習慣、社會因素甚至經濟條件等均可能是導致過敏性咳嗽發生發展的更重要原因。過敏性咳嗽病發病率的增高趨勢也與患者的過敏性體質導致的易感性和環境因素有關。
從單合子雙胞胎在過敏性咳嗽發病中的不一致性來看，環境因素在過敏性咳嗽的發病中可能具有重要作用。環境中變應原的接觸對於患者過敏性咳嗽基因的表達往往是必需條件，環境中變應原的濃度經常可以決定過敏性咳嗽基因的表達水平。
現代醫學認為過敏性咳嗽病患者氣道變應性炎症的形成為諸多因素綜合作用的結果，臨床工作者應分清主次因素，才能有的放矢地開展防治工作。此外病人初次接觸上述不良環境因素的年齡、不良環境的惡劣程度、接觸的頻率以及接觸持續的時間也是決定病人是否由過敏性咳嗽前狀態轉變為過敏性咳嗽病的重要因素，同時也是決定過敏性咳嗽病患者預後和轉歸的關鍵因素。在日常生活中某些誘發過敏性咳嗽的環境因素如塵蟎、真菌、花粉等變應原、病毒和氣候變化等往往持續存在而較難避免，加上隨著現代生活水平的提高，新的過敏源頻頻進入人們的生活領域，人們出差、旅行、度假等機會也增多，活動地域在不斷擴大，所以過敏原的接觸範圍也增大，因此過敏性咳嗽病的防治往往較為困難，防不勝防。
目前多數作者認為應把引起過敏性咳嗽病的諸多因素分為致病因素(Trigger)和誘發因素(Contributor)兩大類，致病因素是指引起過敏性咳嗽病首次發作的因素，是過敏性咳嗽病發病的"扳機"和主要病因，無論在過敏性咳嗽病的發生和發展中均起重要作用;誘發因素是指病人在已患有過敏性咳嗽病的基礎上誘發隱性過敏性咳嗽重新活動或過敏性咳嗽急性發作的因素，是過敏性咳嗽發作過程中的綜合誘發因素之一，在促使過敏性咳嗽病情復發和進一步發展中起重要作用。
在上述兩大類因素中，某些因素如變應原、刺激性氣體和有害氣體、職業性因素、病毒、食物和藥物等兼有雙重作用，既可導致過敏性咳嗽病的發生，又在過敏性咳嗽病情的發展過程中起重要作用。然而，我們應當明確所有的環境因素並非是決定過敏性咳嗽病是否發生的唯一因素，過敏性咳嗽病患者本身的特應性素質也是非常重要的。
