獲得性免疫缺陷綜合徵的臨床表現複雜多樣,可涉及所有系統,表現為機會性感染或相關腫瘤。當患者出現艾滋病的典型症狀時,CD4+細胞計數通常會下降到200/ul以下,未經治療的人在進入這一階段後平均生存期為12至18個月。
常見的機會性感染包括病毒性感染,如鉅細胞病毒視網膜炎、帶狀皰疹(由水痘帶狀皰疹病毒引起)和口腔毛髮白斑病(由EB病毒引起);細菌性感染,如結核病、分枝桿菌感染;真菌性感染,如肺囊蟲肺炎(PCP)、隱球菌腦膜炎,以及引起食道炎和口腔感染的白念珠菌。寄生蟲感染,如弓形蟲腦病和由隱孢子蟲引起的腹瀉。
具有艾滋病代表性表型的常見惡性腫瘤包括非霍奇金淋巴瘤和卡波西肉瘤,腫瘤的發生還與病毒感染有關,淋巴瘤通常與EB病毒感染有關,卡波西肉瘤(Kaposi's sarcoma)與人類皰疹病毒8型感染有關,等等。