1.治療原發病或合併症如痔、肛瘻、蟯蟲病等。給於相應抗生素或抗菌藥治療合併感染。
2.侷限性肛門瘙癢病的藥物治療應以局部外用治療為主，全身治療所用的各類藥劑，如皮質類固醇激素、抗炎症介質類製劑、各種鎮靜劑等對肛瘙癢並無明顯止癢作用，但都有不少副作用或不利影響，在沒有明確適應證情況下應避免應用。
3.對僅有局部瘙癢而肛門皮膚正常者，以硼酸水清洗冷敷肛門，若加冰塊使水溫在4～5℃左右冷敷。患者蹲位以紗布或脫脂棉冷敷肛門，可收立即止癢之效。每日早、晚各一次，每次約5min，冷敷後以乾毛巾拭乾局部，撲以普通爽身粉，保持乾燥。此型肛門瘙癢不宜外敷軟膏，軟膏妨礙散熱，增多汗液易誘發瘙癢。宜用清涼乾燥洗劑，如白色洗劑，爐甘石洗劑等。
4.肛門皮膚呈粗糙肥厚的苔癬化損害者多有合併感染，可用適當抗生素或抗菌藥劑，感染控制後，施行局部包封治療;在清洗局部後，以酒精或新潔爾滅溶液局部消毒，用注射用強的松龍注射液或去炎松注射液以注射針將藥液滴於皮損部位，務使皮損充分浸入藥液，患者感瘙癢減輕，局部藥液乾燥，再按病灶大小貼敷普通橡皮膏或含有止癢劑的軟膏，也可用含有藥物的成膜劑或凝膠劑作膜狀包封。此方法宜於睡前施行，6～8h後去除硬膏或成膜包封物，清洗局部，塗以乾燥洗劑或止癢氣霧劑噴塗。此法對緩解瘙癢促使苔癬化損害消退有佳良效果。
5.注射療法 將藥物注射到皮下或皮內，破壞感覺神經，使局部感覺減退，症狀消失，局部損傷治癒，約50%以上的病例可永久治癒。但嚴格瘙癢者易復發，需再次注射治療，注射藥物不僅破壞感覺神經，也可破壞運動神經，常發生輕重不同的感覺性肛門失禁和括約肌功能不良，但過一時期可自行恢復。
⑴酒精皮下注射：酒精能溶解神經髓鞘，不損傷神經軸，使感覺神經末梢變性，皮膚失去感覺，直到神經再生，注射方法有兩種。①分區皮下注射法：將肛門周圍分成4區，每次注射1區。皮膚消毒後用長針皮下注射普魯卡因溶液，針留在原處，再注射酒精，注射藥物應分佈均勻，不可外流或有張力。也不可注射到皮內，以免皮膚壞死;更不可注射到肛管括約肌內，以防括約肌癱瘓。注射後熱敷，給鎮靜藥止痛，間隔5～10d，再注射另1區，將4區完全注射。②多處皮下注射法：局麻後，用極細針頭經多處穿刺，將酒精注射到肛門周圍皮下，每處距離0.5cm，每處注射2～3滴，避免注射到皮內或括約肌內。
⑵亞甲藍皮內注射：將亞甲藍溶液注射到肛門周圍皮內，使內神經末梢感覺消失，瘙癢消退，注射溶液是亞甲藍和普魯卡因溶於蒸餾水內製成，肛門部皮膚塗以紅汞溶液，用細針將溶液注射到肛門周圍皮內，每處注射3～4滴，將瘙癢區全部注射。總量不超過20ml，注射後肛門部復以無菌紗布，用嗎啡或可待因止痛。
6.手術療法
自發瘙癢經過上述治療後不見好轉或多次復發的可用手術治療。手術方法有除去肛門部皮膚神經支配和切除肛門部皮膚兩種。
⑴皮下切開術：於肛門兩側，距肛緣5cm，各作一半圓形切口，切開皮下脂肪，將皮片向內側分離顯露外括約肌下緣，並向肛管內將皮膚由內括約肌分離到肛門瓣平面。再將肛門前後方皮膚由深部組織分離，使肛門兩側傷口交通。最後將切口外緣的皮膚向外分離1～2cm，止血後將皮片縫於原位，有時需放引流，外蓋壓迫敷料。手術前需準備腸道，手術後控制排糞3～4日。效果，各家報告不一，多數取得良好效果，但有復發病例及傷口感染和裂開的報告。
⑵切除縫合術：沿肛緣由前向後作一切口，在切口外側再作一彎形切口，將有病變皮膚包括在切口內，切口兩端相連，切除2處切口之間的半月形皮膚，縫合傷口。對側同法切除。切除皮膚後可止瘙癢，但傷口有時發生感染。
另：蜂膠抗菌消炎，可治肛門瘙癢
蜂膠的主要成分有黃酮類化合物、有機酸類、酶類、維生素類和礦物質等。蜂膠的作用非常廣，其中之一就是抗菌消炎。所以，對於一些因感染因素所導致的肛門瘙癢，可以嘗試上述方法。但要預防肛門瘙癢，一定要注意個人衛生，如保持局部的乾燥、清潔，勤換洗內褲等，不要用熱水燙洗局部，也不要盲目用一些強效的激素藥膏來止癢。
肛門瘙癢切忌亂用藥
患了肛門瘙癢千萬不要因不好意思而忌諱看醫生，自己濫用一些止癢的藥膏，有些止癢藥膏含有激素成分，儘管當時止癢效果不錯，但後期瘙癢會復發，而且用久之後會有不少副作用。
過多使用肥皂，特別是鹼性強的肥皂，刺激肛周皮膚也易引起肛周瘙癢。起初僅限於肛門周圍的皮膚輕度發癢，如果長期不愈，瘙癢會逐漸蔓延。尤其是到了夜間或是潮溼的環境，瘙癢會加劇。
