可能有人認為，顧名思義，生殖器皰疹一定有水皰。其實，生殖器皰疹不一定有水皰。初次發病者中水皰多見，但復發病人常無明顯的水皰。而且生殖器皰疹的症狀表現多種多樣，可以是典型的集簇性水皰、膿皰、潰瘍及結痂，也可以是紅斑、丘疹、裂隙、硬結、毛囊炎、類似皮膚擦破、包皮龜頭部紅腫滲液等不典型損害。此外，無症狀亞臨床感染者更為普遍。
生殖器皰疹約85%～90%由2型單純皰疹病毒(HSV-2)引起，10%～15%由1型單純皰疹病毒(HSV-1)引起。HSV是一種DNA病毒，核心為線狀雙鏈DNA。
患者如果沒有無單純皰疹的病史，血清中無HSV抗體。感染HSV後，臨床表現最重。患者是與有活動性單純皰疹損害者發生性接觸後發病的。潛伏期3～14 天，平均6天左右。男性好發在龜頭、冠狀溝、包皮、陰莖;女性好發在外陰、宮頸、肛周及臀部，出現多數粟粒大丘疹、水皰，可彼此融合成片。
