中醫學認為扁平疣，疣系陰血不足，肝失榮養，氣血不和，血枯生燥，筋氣外發於肌膚，或風毒之邪侵襲，阻於經絡，凝聚肌膚而成。
現代醫學認為，疣為病毒性皮膚病，尋常疣、扁平疣、尖銳溼疣均由乳頭瘤病毒引起，三者都有表皮角化過度，棘層肥厚，皮突延長等病理改變。傳染性軟疣是由傳染性軟疣病毒(屬痘類病毒)引起，表皮細胞內含有軟化疣小體和發生變性是其特徵。
根據臨床表現，結合病理檢查，鄧可確診，但應與增殖型肛門結核、生殖器癌、生殖器鮑文樣丘疹病相鑑別。
由於疣的種類不同，臨床表現各異：
扁平疣呈米粒及芝麻大扁平隆起的損害，表面光滑，色淺褐或正常皮色。
傳染性軟疣初起為米粒大、半球形丘疹，中心有小白點，逐漸增至如綠豆大，境界明顯，質硬，中心凹陷似臍窩，呈灰白、乳白、微紅或正常皮色，表面光滑。損害數目不定，少數散在，或數個簇集，不想融合，可擠出白色乳酪樣物。
尋常疣初起為米粒大小，微黃色角化性丘疹，中央可見一針頭小紅點，逐漸增至綠豆大小，圓形或多角形乳頭狀隆起，境界明顯，質硬，表面粗糙呈刺狀，灰白，汙染或汙褐色。初發常為1個，長期不變或不斷增多，鄰近者互相融合，有時可自身接種。
標本兼治---HFP免疫抗原修復療法，內服外用徹底清除扁平疣
HFP免疫抗原修復療法抓住扁平疣發病機理，使得治療扁平疣並不是難事，98%以上患者均可康復。HFP免疫抗原修復療法強調個體化治療。不同情況的患者不同施治。
現代中醫治療扁平疣已經不是單純依靠內服中藥的力量，而是同時結合了外用中藥進行治療。外用中藥具有使用方便，見效快，無副作用，不留任何瘢痕和色素沉著等特點。已經成為現在綠色治療扁平疣的科學方法。外用藥物治療扁平疣的機理包括兩個方面：一是使局部疣體蛋白脫水、變性、壞死、結痂脫落;二是增強了局部細胞免疫功能。同時配合HFP高頻脈衝，中西結合，恢復更快。
內服中藥治療扁平疣宜採取清熱利溼、活血化瘀、解毒散結的方法。中藥外擦可疏通經絡，改善局部血液循環，有利於藥物滲透吸收，其本身亦有不同程度的抑菌殺菌作用。結合中藥燻洗也可起到清熱解毒、燥溼散結、補血活血、祛風止癢作用。
