1.藥物因素
大多數進入母體的藥物可以通過胎盤進入胚胎。有些藥物可能影響胚胎的發育並導致畸形，目前已知的抗腫瘤藥物（如環磷酰胺、甲氨蝶呤等）、抗驚厥藥物（苯妥英鈉）、抗組胺藥和治療妊娠嘔吐的明基和一些安眠藥（如沙利度胺）可導致胎兒畸形。
2.物理損傷
例如，在胎兒發育過程中經常接觸輻射或微波，可能影響胎兒的生長髮育，成為發生唇裂的可能誘因。
3.遺傳因素
遺傳因素大多是遺傳性的，常表現為唇顎裂嬰兒的直系或旁系親屬中出現相同的症狀。在易導致唇顎裂的因素中，環境因素的影響更為複雜，這裡指的是胚胎生長髮育的環境。
4.維生素缺乏
例如，在懷孕期間，孕婦可能出現頻繁嘔吐或偏食，導致維生素A、B、鈣、鐵、磷、葉酸的缺乏，再如，孕婦在懷孕期間受到刺激和過度緊張。
5.吸菸和飲酒因素
孕早期大量吸菸和飲酒的婦女，其子女唇裂的發生率高於無吸菸和飲酒習慣的婦女，是導致胎兒唇裂發生的可能因素之一。
