(1)三叉神經後根和半月神經節的病變
三叉神經後根的病變(顱後窩)如小腦腦橋角區的表皮樣囊腫(膽脂瘤)、神經鞘瘤、腦膜瘤、神經纖維瘤、蛛網膜囊腫或粘連，其次有骨瘤、軟骨瘤、血管細胞瘤、膠質瘤及動脈瘤等。半月神經節的病變(顱中窩)，凡是顱中窩腦底部的病變均可侵犯半月神經節，如顱底部的各種腫瘤、顳葉下部腦膜瘤、血管瘤、顱底的轉移瘤或顱底的炎症粘連等。以上部位的病變除引發三叉神經痛症狀外，對臨近組織結構多有侵犯，因此，可出現相應部位症狀和體徵。如三叉神經系統分佈區域的感覺和運動障礙，或同時出現帶狀皰疹，這一特徵性體徵的出現，有人認為是診斷半月神經節病變的重要依據。
(2)腦幹病變
腦幹是幾乎所有傳導束必經之路和許多重要生命中樞所在地。故腦幹一旦出現病變，輕者有神經功能障礙，重者在短期內死亡。引起三叉神經痛的常見病變有延髓空洞症、腦幹血管病變、炎症、腫瘤、每度、多發性硬化等。
(3)半月神經節前根(周圍支)病變
此部位的病變最常見的有眶內腫瘤、眶上裂區炎症或腫瘤、海綿竇的病變、副鼻竇的炎症或腫瘤以及牙源性病灶等，均可侵犯三叉神經的根或周圍支而發生三叉神經痛。
