非淋菌性尿道炎除根據病史及體徵外，需將尿道分泌物行塗片染色檢查或細菌培養，以明確致病菌。男性病人若無尿道分泌物，應進行三杯試驗(即前尿道炎第1杯尿渾濁有大量膿細胞白細胞，第23杯清晰後尿道炎，第13杯渾濁有大量膿細胞白細胞第2杯清晰)急性期尿道內忌用器械檢查。
1、有婚外性接觸史或配偶感染史，潛伏期1周～3周。
2、有不潔性接觸史。
3、本病可經產道傳染，引起新生兒眼結膜炎、肺炎、鼻炎、中耳炎和女嬰的陰道炎。
4、PCR法可查到砂眼衣原體或解脲支原體DNA，但有一定的假陽性率。
5、合併症男性主要合併症為附睪丸炎，前列腺炎及Reiter綜合徵等;女性主要為輸卵管炎、盆腔炎、異位妊娠及不育症等。
6、分泌物塗片和培養無淋菌者。分泌物塗片，革蘭氏染色陰道毛滴蟲或展起首次(或尿後2～3小時)小便做離心沉澱，取沉澱物進行檢查，高倍鏡下每視野有10～15個以上多形核白細胞者，培養可檢出衣原體或支原體。
7、分泌物塗片和培養淋球菌均為陰性，而塗片鏡檢，在油鏡(1000倍)視野下多形核白細胞超過4個或者晨尿，前段尿15毫升沉澱，在高倍(400倍)視野下，每視野多形核白細胞超過15個，有診斷意義。
8、非淋菌性尿道炎常見的臨床表現。男性患者常有漿液性或粘液膿性分泌物從尿道口流出或排尿疼痛。女性患者常有尿頻及排尿困難。如波及宮頸時，表現為炎症和糜爛，分泌物增多，陰道及外防瘙癢，但也有些病人無症狀。
在排除了淋病之後，凡符合上述3條標準中的2條，即可診斷為非淋菌性尿道炎。如患者有尿道炎症狀，但檢查時未見分泌物或顯微鏡未見有尿道炎的證據，應在7天內複查。複查前4～8小時不排尿。如果患者在複查時，僅符合上述一條標準，則應取首段尿作尿沉渣鏡檢，在500倍顯微鏡視野下如果多形核白細胞大於15個，也可確立診斷。
