腎結石的症狀——疼痛和血尿，取決於結石的大小，引起梗阻的程度和有無繼發感染。在腎孟中不活的結石而又無感染時，可長期無症狀，甚至結石已引起腎功能不足時還無自覺症狀，只在攝腹部B超和X線照片時偶然發現。但大多數患者有症狀。腎結石患者腎臟內的結石可能長期存在，可是患者卻沒有明顯症狀表現。這種情況一般在結石偏大的腎病患者身上體現出來。若腎結石患者體內的結石偏小的話，則結石在體內的活動範圍較大，當小結石進入病人的腎盂、輸尿管等部位時，輸尿管將發生劇烈的蠕動，以便促使結石的排出。這時患者就會出現持續的腹痛和血尿症狀。
由腎結石引發的疼痛分為鈍痛和絞痛兩種，疼痛常位於病人腰腹部、多呈現陣發性，有時亦可表現為持續性疼痛。還有少數腎結石病人的腹痛僅僅表現為要不酸脹不適，只有在活動或勞動後才能感覺到明顯的疼痛。對於嚴重的腎結石病人，其所感受到的腹痛常呈嚴重的刀割樣痛，疼痛可能突然發作，並多向下腹部、腹股溝或股內側放射。如為女性腎結石病人，疼痛可能還將會放射至外陰部位。
